Was ist der Unterschied zwischen 16s-rRNA und 18s-RRNA?
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Video: 16S rRNA Sequencing | 16S Ribosomal RNA | Why 16S rRNA is Important | 16S rRNA Uses | 2024, November
Anonim

Das Wichtigste Unterschied zwischen Durchführung von Analysen mit 18S-rRNA Gendaten statt 16S-rRNA Gendaten (oder ITS-Daten) sind die Referenzdatenbank für das OTU-Picking, die taxonomischen Zuordnungen und das Template-basierte Alignment-Building, da sie eukaryontische Sequenzen enthalten müssen.

Warum wird in Anbetracht dessen das 16s-rRNA-Gen zur Identifizierung verwendet?

Die 16S ribosomales RNA-Gen kodiert für die RNA-Komponente der 30S-Untereinheit des bakteriellen Ribosoms. Aufgrund der Komplexität der DNA-DNA-Hybridisierung 16S rRNA-Gen Sequenzierung ist Gebraucht als Werkzeug zu identifizieren Bakterien auf Speziesebene und helfen bei der Unterscheidung zwischen eng verwandten Bakterienarten [8].

Haben Eukaryoten außerdem 16s rRNA? Die 16S-rRNA Gen ist in allen Bakterien vorhanden, und eine verwandte Form kommt in allen Zellen vor, einschließlich derer von Eukaryoten.

Die Frage ist auch, was ist 18s- und 28s-rRNA?

Die 28S / 18S ribosomale RNA Das Verhältnis wird häufig verwendet, um die Qualität der aus einer bestimmten Probe gereinigten Gesamt-RNA zu beurteilen. In Menschen, 28S-rRNA hat ~5070 Nukleotide und 18S hat 1869 Nukleotide, was a 28S / 18S Verhältnis von ~2,7. Ein hoch 28S / 18S Das Verhältnis ist ein Hinweis darauf, dass die gereinigte RNA intakt ist und nicht abgebaut wurde.

Was ist 16s rRNA-Sequenzierung?

16S-rRNA Gen Reihenfolge Die Analyse ist eine Standardmethode in der bakteriellen Taxonomie und Identifizierung und basiert auf dem Nachweis von Reihenfolge Unterschiede (Polymorphismen) in den hypervariablen Regionen der 16S-rRNA Gen, das in allen Bakterien vorhanden ist.

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